Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPCQ03188 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPCQ03188 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPCQ03188 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms