Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX5Q02548 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX5Q02548 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms