Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC2Q02487 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC2Q02487 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC2Q02487 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms