Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKOR1P84550 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SKOR1P84550 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKOR1P84550 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKOR1P84550 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms