Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCT2P78371 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCT2P78371 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCT2P78371 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT2P78371 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT2P78371 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT2P78371 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT2P78371 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCT2P78371 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT2P78371 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT2P78371 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT2P78371 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCT2P78371 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT2P78371 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT2P78371 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCT2P78371 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT2P78371 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT2P78371 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT2P78371 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT2P78371 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT2P78371 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT2P78371 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT2P78371 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT2P78371 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT2P78371 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT2P78371 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT2P78371 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT2P78371 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT2P78371 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT2P78371 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT2P78371 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT2P78371 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT2P78371 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT2P78371 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT2P78371 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT2P78371 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCT2P78371 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT2P78371 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT2P78371 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT2P78371 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT2P78371 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT2P78371 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT2P78371 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT2P78371 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT2P78371 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT2P78371 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT2P78371 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT2P78371 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT2P78371 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT2P78371 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT2P78371 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT2P78371 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT2P78371 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms