Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ASIC1P78348 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC1P78348 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 955.6 ms