Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA2P62736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA2P62736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms