Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX1BP61266 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX1BP61266 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX1BP61266 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX1BP61266 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1BP61266 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1BP61266 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1BP61266 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1BP61266 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX1BP61266 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX1BP61266 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms