Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3S2P59780 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3S2P59780 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3S2P59780 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms