Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP9P55211 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP9P55211 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP9P55211 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP9P55211 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP9P55211 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP9P55211 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP9P55211 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP9P55211 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP9P55211 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP9P55211 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP9P55211 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP9P55211 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP9P55211 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP9P55211 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP9P55211 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP9P55211 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP9P55211 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP9P55211 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP9P55211 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP9P55211 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP9P55211 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms