Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP14P54578 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP14P54578 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP14P54578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP14P54578 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP14P54578 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP14P54578 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP14P54578 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP14P54578 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP14P54578 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP14P54578 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP14P54578 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP14P54578 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP14P54578 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP14P54578 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP14P54578 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP14P54578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP14P54578 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP14P54578 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP14P54578 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP14P54578 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP14P54578 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP14P54578 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP14P54578 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP14P54578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP14P54578 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP14P54578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP14P54578 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP14P54578 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP14P54578 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP14P54578 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP14P54578 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP14P54578 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP14P54578 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP14P54578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP14P54578 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP14P54578 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP14P54578 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP14P54578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP14P54578 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP14P54578 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP14P54578 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP14P54578 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP14P54578 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP14P54578 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP14P54578 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP14P54578 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP14P54578 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP14P54578 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP14P54578 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP14P54578 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP14P54578 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP14P54578 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP14P54578 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP14P54578 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP14P54578 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP14P54578 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP14P54578 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP14P54578 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms