Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P54278 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P54278 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMS2P54278 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P54278 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P54278 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P54278 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P54278 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P54278 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P54278 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P54278 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P54278 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P54278 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P54278 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P54278 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMS2P54278 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P54278 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMS2P54278 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P54278 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P54278 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P54278 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P54278 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P54278 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P54278 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P54278 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P54278 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P54278 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P54278 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P54278 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P54278 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P54278 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P54278 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P54278 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P54278 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P54278 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P54278 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P54278 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS2P54278 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P54278 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms