Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2KP53803 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.9 ms