Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBX1P52954 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBX1P52954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LBX1P52954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBX1P52954 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBX1P52954 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LBX1P52954 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LBX1P52954 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LBX1P52954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LBX1P52954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LBX1P52954 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LBX1P52954 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBX1P52954 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBX1P52954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBX1P52954 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBX1P52954 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBX1P52954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LBX1P52954 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBX1P52954 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBX1P52954 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBX1P52954 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LBX1P52954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LBX1P52954 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBX1P52954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBX1P52954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBX1P52954 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBX1P52954 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBX1P52954 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBX1P52954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBX1P52954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBX1P52954 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBX1P52954 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LBX1P52954 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LBX1P52954 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LBX1P52954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LBX1P52954 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LBX1P52954 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LBX1P52954 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBX1P52954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBX1P52954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LBX1P52954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LBX1P52954 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LBX1P52954 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBX1P52954 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBX1P52954 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBX1P52954 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBX1P52954 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LBX1P52954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LBX1P52954 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBX1P52954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBX1P52954 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBX1P52954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBX1P52954 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms