Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP98P52948 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NUP98P52948 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP98P52948 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP98P52948 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP98P52948 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP98P52948 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP98P52948 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP98P52948 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP98P52948 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP98P52948 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP98P52948 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP98P52948 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP98P52948 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP98P52948 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP98P52948 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP98P52948 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP98P52948 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP98P52948 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP98P52948 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP98P52948 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP98P52948 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP98P52948 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP98P52948 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP98P52948 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP98P52948 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP98P52948 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP98P52948 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP98P52948 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP98P52948 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP98P52948 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP98P52948 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP98P52948 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP98P52948 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP98P52948 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP98P52948 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP98P52948 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUP98P52948 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUP98P52948 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP98P52948 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP98P52948 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP98P52948 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP98P52948 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP98P52948 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP98P52948 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP98P52948 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP98P52948 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP98P52948 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP98P52948 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP98P52948 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP98P52948 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms