Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR1P51861 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDR1P51861 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDR1P51861 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDR1P51861 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDR1P51861 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDR1P51861 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDR1P51861 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDR1P51861 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDR1P51861 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDR1P51861 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDR1P51861 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR1P51861 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR1P51861 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR1P51861 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR1P51861 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDR1P51861 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR1P51861 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR1P51861 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR1P51861 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDR1P51861 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR1P51861 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR1P51861 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR1P51861 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR1P51861 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDR1P51861 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR1P51861 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR1P51861 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR1P51861 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDR1P51861 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR1P51861 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR1P51861 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR1P51861 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR1P51861 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDR1P51861 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR1P51861 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR1P51861 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDR1P51861 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR1P51861 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR1P51861 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDR1P51861 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR1P51861 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR1P51861 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDR1P51861 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms