Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNMTP50135 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNMTP50135 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNMTP50135 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNMTP50135 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNMTP50135 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNMTP50135 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNMTP50135 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNMTP50135 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNMTP50135 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNMTP50135 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNMTP50135 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNMTP50135 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNMTP50135 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNMTP50135 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNMTP50135 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNMTP50135 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNMTP50135 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNMTP50135 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNMTP50135 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNMTP50135 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNMTP50135 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNMTP50135 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNMTP50135 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNMTP50135 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HNMTP50135 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNMTP50135 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HNMTP50135 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNMTP50135 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNMTP50135 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNMTP50135 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNMTP50135 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HNMTP50135 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNMTP50135 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNMTP50135 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNMTP50135 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNMTP50135 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNMTP50135 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNMTP50135 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNMTP50135 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNMTP50135 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HNMTP50135 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HNMTP50135 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNMTP50135 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HNMTP50135 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNMTP50135 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNMTP50135 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNMTP50135 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNMTP50135 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNMTP50135 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNMTP50135 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms