Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGS4P49798 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGS4P49798 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGS4P49798 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGS4P49798 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGS4P49798 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGS4P49798 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGS4P49798 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGS4P49798 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGS4P49798 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGS4P49798 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGS4P49798 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGS4P49798 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGS4P49798 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGS4P49798 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGS4P49798 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGS4P49798 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGS4P49798 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGS4P49798 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGS4P49798 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGS4P49798 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGS4P49798 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGS4P49798 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGS4P49798 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGS4P49798 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGS4P49798 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGS4P49798 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms