Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNTAP49354 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNTAP49354 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTAP49354 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTAP49354 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTAP49354 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNTAP49354 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTAP49354 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTAP49354 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNTAP49354 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNTAP49354 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNTAP49354 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FNTAP49354 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNTAP49354 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNTAP49354 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTAP49354 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTAP49354 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNTAP49354 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNTAP49354 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNTAP49354 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FNTAP49354 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNTAP49354 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms