Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNNI2P48788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNI2P48788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms