Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSR1P43307 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSR1P43307 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSR1P43307 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSR1P43307 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSR1P43307 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSR1P43307 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSR1P43307 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSR1P43307 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSR1P43307 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSR1P43307 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSR1P43307 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSR1P43307 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSR1P43307 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSR1P43307 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSR1P43307 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSR1P43307 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSR1P43307 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSR1P43307 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSR1P43307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSR1P43307 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSR1P43307 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSR1P43307 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSR1P43307 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSR1P43307 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSR1P43307 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSR1P43307 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSR1P43307 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSR1P43307 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSR1P43307 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSR1P43307 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSR1P43307 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSR1P43307 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSR1P43307 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSR1P43307 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSR1P43307 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSR1P43307 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSR1P43307 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSR1P43307 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSR1P43307 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSR1P43307 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSR1P43307 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSR1P43307 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSR1P43307 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSR1P43307 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSR1P43307 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSR1P43307 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSR1P43307 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms