Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A2P43004 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms