Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRPPRCP42704 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRPPRCP42704 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms