Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA1P42261 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA1P42261 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA1P42261 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms