Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARL4AP40617 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARL4AP40617 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4AP40617 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4AP40617 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms