Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 TPK1YJL164C 1194 nt6.6□□□□□ -1.35
SHQ1P40486 RGD1YBR260C 2001 nt6.6□□□□□ -1.35
SHQ1P40486 SKI2YLR398C 3864 nt6.6□□□□□ -1.35
SHQ1P40486 PYK2YOR347C 1521 nt6.6□□□□□ -1.35
SHQ1P40486 POX1YGL205W 2247 nt6.6□□□□□ -1.35
SHQ1P40486 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 MRS1YIR021W 1092 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 ZRT2YLR130C 1269 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 RPS28AYOR167C 204 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 KKQ8YKL168C 2175 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 CRF1YDR223W 1404 nt6.58□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 HST3YOR025W 1344 nt6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 CDC34YDR054C 888 nt6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 OAC1YKL120W 975 nt6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 PSR2YLR019W 1194 nt6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 CSC1YLR241W 2349 nt6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 MRC1YCL061C 3291 nt6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 VPS4YPR173C 1314 nt6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 NHA1YLR138W 2958 nt6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 VPS5YOR069W 2028 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 BCY1YIL033C 1251 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 TSA1YML028W 591 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 VMA4YOR332W 702 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 KEL1YHR158C 3495 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 MDM31YHR194W 1740 nt6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 GFA1YKL104C 2154 nt6.54□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 YET3YDL072C 612 nt6.54□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 MOG1YJR074W 657 nt6.54□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 AIM3YBR108W 2844 nt6.54□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 FRS2YFL022C 1512 nt6.54□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 RPN11YFR004W 921 nt6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 RPE1YJL121C 717 nt6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 IFA38YBR159W 1044 nt6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 GYP8YFL027C 1494 nt6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P40486 PKC1YBL105C 3456 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 EHD3YDR036C 1503 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YIL055CYIL055C 1884 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 MAK31YCR020C-A 267 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YEL068CYEL068C 333 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YHL018WYHL018W 363 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 MRPS12YNR036C 462 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YPR114WYPR114W 948 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 IVY1YDR229W 1362 nt6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 MCM3YEL032W 2916 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 ERP2YAL007C 648 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 LDS1YAL018C 978 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YHM2YMR241W 945 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 FRE5YOR384W 2085 nt6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YDL218WYDL218W 954 nt6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YDR015CYDR015C 240 nt6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 PHB1YGR132C 864 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 TIF2YJL138C 1188 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 TIF1YKR059W 1188 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 MRPS16YPL013C 366 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 YFL042CYFL042C 2025 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 PAT1YCR077C 2391 nt6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 AFG1YEL052W 1530 nt6.48□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 GAT1YFL021W 1533 nt6.48□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 LYS21YDL131W 1323 nt6.48□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 ATG4YNL223W 1485 nt6.47□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 ESC8YOL017W 2145 nt6.47□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 HXT2YMR011W 1626 nt6.47□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 RAD3YER171W 2337 nt6.47□□□□□ -1.37
SHQ1P40486 RPL7AYGL076C 735 nt6.46□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 YNL285WYNL285W 372 nt6.46□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 YNR040WYNR040W 771 nt6.46□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 RPL7BYPL198W 735 nt6.46□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 ICL1YER065C 1674 nt6.45□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 XBP1YIL101C 1944 nt6.45□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 YJU3YKL094W 942 nt6.45□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 CAF40YNL288W 1122 nt6.45□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 UIP4YPL186C 915 nt6.45□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 TAL1YLR354C 1008 nt6.44□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 HAP3YBL021C 435 nt6.44□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 JNM1YMR294W 1122 nt6.44□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 RMD9YGL107C 1941 nt6.43□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 SIT4YDL047W 936 nt6.43□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 BUD32YGR262C 786 nt6.43□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 RPL10YLR075W 666 nt6.43□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 ENV7YPL236C 1095 nt6.43□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 CLB2YPR119W 1476 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 GPB2YAL056W 2643 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 RSA4YCR072C 1548 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 SKS1YPL026C 1509 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 SEN34YAR008W 828 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 YOR200WYOR200W 399 nt6.42□□□□□ -1.38
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