Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL13AP40429 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPL13AP40429 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL13AP40429 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms