Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 RIM101YHL027W 1878 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 ALT1YLR089C 1779 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 PAP2YOL115W 1755 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 CLB1YGR108W 1416 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 KSH1YNL024C-A 219 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 PZF1YPR186C 1290 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 EPS1YIL005W 2106 nt5.27□□□□□ -1.57
AVT5P38176 DOT1YDR440W 1749 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YNL120CYNL120C 486 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 ZIM17YNL310C 525 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 COQ3YOL096C 939 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 RKI1YOR095C 777 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 ATG23YLR431C 1362 nt5.26□□□□□ -1.57
AVT5P38176 IME2YJL106W 1938 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YHK8YHR048W 1545 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 PGK1YCR012W 1251 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 TIM22YDL217C 624 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 RNH1YMR234W 1047 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 VMA4YOR332W 702 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 LGE1YPL055C 999 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 DRS1YLL008W 2259 nt5.25□□□□□ -1.57
AVT5P38176 PDR18YNR070W 4002 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YDR278CYDR278C 318 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 REV7YIL139C 738 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YIR042CYIR042C 711 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 CDC11YJR076C 1248 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 AIM24YJR080C 1185 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 AAD14YNL331C 1131 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 MCP1YOR228C 909 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 GEX1YCL073C 1848 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 GEX2YKR106W 1848 nt5.24□□□□□ -1.57
AVT5P38176 PEX3YDR329C 1326 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 CNE1YAL058W 1509 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YJR146WYJR146W 354 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 SLD7YOR060C 774 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YPL071CYPL071C 471 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YPL257WYPL257W 582 nt5.23□□□□□ -1.57
AVT5P38176 MAL11YGR289C 1851 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 TRP3YKL211C 1455 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YHR145CYHR145C 357 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 YKL077WYKL077W 1179 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 DID2YKR035W-A 615 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 RSC2YLR357W 2670 nt5.22□□□□□ -1.57
AVT5P38176 GUF1YLR289W 1938 nt5.21□□□□□ -1.57
AVT5P38176 MCH1YDL054C 1461 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 IES1YFL013C 2079 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 FAL1YDR021W 1200 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YRB2YIL063C 984 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 HOC1YJR075W 1191 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YOL163WYOL163W 510 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YGR054WYGR054W 1929 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YAP1801YHR161C 1914 nt5.21□□□□□ -1.58
AVT5P38176 MDH3YDL078C 1032 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YJL193WYJL193W 1209 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 AVO2YMR068W 1281 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 POR1YNL055C 852 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 RUF23RUF23 254 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 MRPL23YOR150W 492 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 SPE3YPR069C 882 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 TBF1YPL128C 1689 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 MSN2YMR037C 2115 nt5.2□□□□□ -1.58
AVT5P38176 MNN5YJL186W 1761 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 VTC2YFL004W 2487 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 ISN1YOR155C 1353 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 RNR3YIL066C 2610 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 QCR8YJL166W 285 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 LIA1YJR070C 978 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YAR064WYAR064W 300 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 OGG1YML060W 1131 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 ODC2YOR222W 924 nt5.19□□□□□ -1.58
AVT5P38176 DEF1YKL054C 2217 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 VMA3YEL027W 483 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 CHO1YER026C 831 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 LYS1YIR034C 1122 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 ASF1YJL115W 840 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 PYC2YBR218C 3543 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YLL067CYLL067C 3618 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 TEP1YNL128W 1305 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 HRQ1YDR291W 3234 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT5P38176 FMO1YHR176W 1299 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT5P38176 URA1YKL216W 945 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT5P38176 CRH1YGR189C 1524 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 BMT5YIL096C 1011 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 RPE1YJL121C 717 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 LDB7YBL006C 543 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 GLN1YPR035W 1113 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 LDB16YCL005W 771 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 UTP6YDR449C 1323 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YMR027WYMR027W 1413 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT5P38176 BIO3YNR058W 1443 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT5P38176 VBA1YMR088C 1689 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT5P38176 FAT3YKL187C 2253 nt5.15□□□□□ -1.58
AVT5P38176 YDL023CYDL023C 321 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT5P38176 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT5P38176 MDE1YJR024C 735 nt5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms