Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX5P35711 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX5P35711 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX5P35711 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX5P35711 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX5P35711 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX5P35711 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX5P35711 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX5P35711 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX5P35711 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX5P35711 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX5P35711 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX5P35711 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX5P35711 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX5P35711 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX5P35711 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX5P35711 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX5P35711 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX5P35711 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX5P35711 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX5P35711 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX5P35711 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX5P35711 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX5P35711 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SOX5P35711 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX5P35711 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX5P35711 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX5P35711 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX5P35711 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX5P35711 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX5P35711 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX5P35711 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX5P35711 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX5P35711 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX5P35711 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX5P35711 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX5P35711 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX5P35711 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX5P35711 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX5P35711 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX5P35711 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX5P35711 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX5P35711 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX5P35711 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX5P35711 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX5P35711 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX5P35711 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX5P35711 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX5P35711 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX5P35711 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX5P35711 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX5P35711 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX5P35711 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX5P35711 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX5P35711 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX5P35711 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX5P35711 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX5P35711 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX5P35711 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms