Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA1P35221 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA1P35221 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms