Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA4P35212 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA4P35212 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA4P35212 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA4P35212 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA4P35212 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA4P35212 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA4P35212 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA4P35212 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA4P35212 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA4P35212 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA4P35212 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA4P35212 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA4P35212 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA4P35212 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA4P35212 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA4P35212 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJA4P35212 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJA4P35212 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA4P35212 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA4P35212 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA4P35212 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJA4P35212 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA4P35212 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJA4P35212 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA4P35212 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA4P35212 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA4P35212 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJA4P35212 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA4P35212 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA4P35212 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJA4P35212 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJA4P35212 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA4P35212 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA4P35212 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJA4P35212 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJA4P35212 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJA4P35212 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms