Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYKP34925 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYKP34925 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYKP34925 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYKP34925 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYKP34925 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYKP34925 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYKP34925 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYKP34925 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RYKP34925 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYKP34925 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RYKP34925 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYKP34925 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYKP34925 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYKP34925 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYKP34925 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYKP34925 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYKP34925 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYKP34925 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYKP34925 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RYKP34925 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYKP34925 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RYKP34925 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYKP34925 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYKP34925 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYKP34925 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYKP34925 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RYKP34925 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RYKP34925 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RYKP34925 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYKP34925 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RYKP34925 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RYKP34925 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms