Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA3P34903 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA3P34903 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA3P34903 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms