Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIPP30301 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIPP30301 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIPP30301 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIPP30301 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIPP30301 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MIPP30301 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MIPP30301 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIPP30301 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIPP30301 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIPP30301 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIPP30301 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIPP30301 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIPP30301 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIPP30301 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIPP30301 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIPP30301 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIPP30301 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIPP30301 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIPP30301 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIPP30301 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIPP30301 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIPP30301 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MIPP30301 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MIPP30301 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIPP30301 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIPP30301 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIPP30301 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIPP30301 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIPP30301 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MIPP30301 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIPP30301 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIPP30301 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIPP30301 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIPP30301 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIPP30301 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MIPP30301 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIPP30301 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIPP30301 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIPP30301 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIPP30301 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIPP30301 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIPP30301 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIPP30301 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms