Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LTKP29376 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LTKP29376 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LTKP29376 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LTKP29376 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LTKP29376 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTKP29376 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTKP29376 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTKP29376 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LTKP29376 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LTKP29376 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LTKP29376 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LTKP29376 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LTKP29376 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LTKP29376 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LTKP29376 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LTKP29376 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LTKP29376 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LTKP29376 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
LTKP29376 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LTKP29376 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LTKP29376 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LTKP29376 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LTKP29376 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LTKP29376 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LTKP29376 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LTKP29376 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
LTKP29376 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LTKP29376 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LTKP29376 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
LTKP29376 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LTKP29376 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LTKP29376 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LTKP29376 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LTKP29376 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LTKP29376 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LTKP29376 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LTKP29376 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LTKP29376 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LTKP29376 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTKP29376 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTKP29376 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTKP29376 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTKP29376 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LTKP29376 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LTKP29376 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LTKP29376 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LTKP29376 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTKP29376 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTKP29376 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTKP29376 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTKP29376 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LTKP29376 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LTKP29376 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
LTKP29376 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LTKP29376 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LTKP29376 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LTKP29376 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTKP29376 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTKP29376 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTKP29376 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LTKP29376 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LTKP29376 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LTKP29376 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTKP29376 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LTKP29376 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LTKP29376 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LTKP29376 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LTKP29376 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LTKP29376 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LTKP29376 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LTKP29376 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LTKP29376 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms