Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TBPP20226 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TBPP20226 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TBPP20226 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TBPP20226 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBPP20226 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBPP20226 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBPP20226 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TBPP20226 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBPP20226 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBPP20226 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBPP20226 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBPP20226 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBPP20226 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBPP20226 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBPP20226 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBPP20226 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TBPP20226 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TBPP20226 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms