Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LBPP18428 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LBPP18428 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LBPP18428 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBPP18428 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBPP18428 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBPP18428 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LBPP18428 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LBPP18428 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBPP18428 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBPP18428 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBPP18428 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBPP18428 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBPP18428 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBPP18428 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LBPP18428 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LBPP18428 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LBPP18428 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LBPP18428 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LBPP18428 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LBPP18428 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms