Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRAP16234 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms