Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD44P16070 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD44P16070 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD44P16070 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD44P16070 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CD44P16070 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CD44P16070 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CD44P16070 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD44P16070 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD44P16070 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CD44P16070 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD44P16070 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD44P16070 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD44P16070 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD44P16070 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD44P16070 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD44P16070 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD44P16070 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CD44P16070 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD44P16070 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD44P16070 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD44P16070 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD44P16070 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD44P16070 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD44P16070 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD44P16070 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD44P16070 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD44P16070 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD44P16070 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD44P16070 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD44P16070 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD44P16070 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD44P16070 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CD44P16070 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD44P16070 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD44P16070 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD44P16070 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD44P16070 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD44P16070 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD44P16070 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD44P16070 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD44P16070 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD44P16070 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms