Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSPT1P15170 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GSPT1P15170 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSPT1P15170 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms