Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP1A3P13637 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP1A3P13637 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms