Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GZMAP12544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GZMAP12544 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GZMAP12544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GZMAP12544 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GZMAP12544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GZMAP12544 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GZMAP12544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GZMAP12544 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GZMAP12544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GZMAP12544 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GZMAP12544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GZMAP12544 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GZMAP12544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GZMAP12544 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GZMAP12544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GZMAP12544 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GZMAP12544 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GZMAP12544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GZMAP12544 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GZMAP12544 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GZMAP12544 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GZMAP12544 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GZMAP12544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GZMAP12544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GZMAP12544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GZMAP12544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GZMAP12544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GZMAP12544 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GZMAP12544 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GZMAP12544 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GZMAP12544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GZMAP12544 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GZMAP12544 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GZMAP12544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GZMAP12544 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms