Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PYGBP11216 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PYGBP11216 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYGBP11216 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYGBP11216 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYGBP11216 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYGBP11216 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYGBP11216 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYGBP11216 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PYGBP11216 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PYGBP11216 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYGBP11216 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYGBP11216 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYGBP11216 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYGBP11216 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYGBP11216 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYGBP11216 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYGBP11216 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYGBP11216 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYGBP11216 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PYGBP11216 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PYGBP11216 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PYGBP11216 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PYGBP11216 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PYGBP11216 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PYGBP11216 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PYGBP11216 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms