Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM6P0DI80 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms