Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC4LP0CB38 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC4LP0CB38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC4LP0CB38 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms