Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPB2P08579 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPB2P08579 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms