Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGN2P05204 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGN2P05204 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms