Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNW1P05000 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms