Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GYPCP04921 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYPCP04921 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYPCP04921 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GYPCP04921 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYPCP04921 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GYPCP04921 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GYPCP04921 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GYPCP04921 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GYPCP04921 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GYPCP04921 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYPCP04921 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYPCP04921 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYPCP04921 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GYPCP04921 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYPCP04921 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYPCP04921 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYPCP04921 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYPCP04921 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYPCP04921 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYPCP04921 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYPCP04921 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYPCP04921 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYPCP04921 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GYPCP04921 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYPCP04921 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYPCP04921 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYPCP04921 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GYPCP04921 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYPCP04921 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYPCP04921 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYPCP04921 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPCP04921 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPCP04921 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPCP04921 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPCP04921 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GYPCP04921 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GYPCP04921 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GYPCP04921 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GYPCP04921 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms