Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1RP00736 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1RP00736 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1RP00736 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1RP00736 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1RP00736 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1RP00736 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1RP00736 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1RP00736 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C1RP00736 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1RP00736 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1RP00736 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1RP00736 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1RP00736 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1RP00736 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1RP00736 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1RP00736 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1RP00736 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1RP00736 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C1RP00736 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1RP00736 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1RP00736 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1RP00736 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1RP00736 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1RP00736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C1RP00736 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1RP00736 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1RP00736 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1RP00736 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1RP00736 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1RP00736 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1RP00736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1RP00736 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1RP00736 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1RP00736 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1RP00736 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1RP00736 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1RP00736 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1RP00736 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms